Proganochelys är en av de äldsta kända sköldpaddorna och på många sätt liknade den de sköldpaddor som finns idag. Som andra sköldpaddor saknade den tänder i käkarna men hade en näbb av hornämne. Men Proganochelys hade till skillnad från andra sköldpaddor tänder som satt i gommen.

Likheten med moderna sköldpaddor är ryggskölden som bildats av hårda plattor och sammansmälta revben. En skillnad mot alla moderna sköldpaddor är den långa svansen med taggar som slutar med en klubba.

Proganochelys kunde inte dra tillbaka sitt huvud under ryggskölden, istället var halsen skyddad av taggar.